En el marco de la promoción del Software Libre, la Fundación FUDECyT implementa Moodle, un sistema de gestión de cursos para instituciones, o educadores en general, orientado a que los alumnos puedan realizar su aprendizaje en línea, por objetivos, de manera flexible y eficaz. Asimismo, para que puedan acompañar la enseñanza presencial.
Este tipo de plataformas tecnológicas, imprescindible para la enseñanza actual, es utilizada por FUDECyT para los campus virtuales de sus Instituto República de Educación Integral, Instituto de Formación Docente y Técnica del Bicentenario, y para su área de cursos.
La Fundación FUDECyT también diseña los Campus para institutos de terceros que están interesados en estas herramientas de enseñanza.